by. 거미
생명과학전공 2년에 약대 4년이면 백지에 아미노산을 그릴 수 있나?네, 사실입니다.생화학 1, 2를 전적대와 약대에서 각각 총 4번 수강했기에 시험공부하면서 아미노산 구조만 도대체 몇 번이나 외운 거에요!
고등학교 3학년 때 학교 생물 선생님이 대학시절 무용담이라며 대학에 가면 지금 교과서에 나와 있는 아미노산 분자구조를 모두 그리도록 하겠다고 했을 때 그 대학이 이상하다는 생각이 들었습니다. 그게 내가 다닌 대학이라니…
이제 어연 6학년이 되었지만 진정한 선생님이신 교수님께서 직접 글자로 아미노산 구조 전부를 백지에 그리는 문제를 출제할 예정이라고 안내해 주신 덕분에 다시 외우게 되었습니다. ◡̈
도대체 누구야 너는?나랑 아는 사이였나?
꼭 알고 졸업하기를 바라는 교수님의 마음이 싫지 않고 그렇게 많이 외웠는데도 또 잊어버린 제가 싫었습니다. wwwww
제가 암기법도 썩 잘하지는 못하지만 그래도 뭐 하나라도 꺼내주시면 하고 정리합니다.
아, 정리하기 전에 먼저 보여드릴게요
원래는 저 혼자 보려고 만든 거라 암기 요령이라고 써있는 게 무슨 소리냐는 게 단점이에요.- 아미노산 분류(classification)- 아미노산의 정식 명칭-세 글자 이름(3digitabbreviation)-한 글자 이름(1digitabbreviation)-아미노산 구조가 그려져 있습니다.
일반적으로 세 글자 이름은 영어 이름 앞에서 세 글자, 한글 이름은 영어 이름의 첫 글자이지만 회색 음영 처리된 것은 그 예외입니다.처리된것은그예외입니다.
외울 때 신경써야할 부분은 그놈들이죠?
번호에V표시된것은내기준구조가헷갈렸던친구이기때문에주관적인기준이기때문에마음에안드신다면무시를하셔도됩니다.
편집해서 쓰고 싶은 분도 계실 것 같아서 굿노트 파일도 첨부하지만 저는 주변에서 이걸 쓰는 데 성공하지 못했습니다.
항상 깨졌죠
아미노산과 친해지는_연습용.pdf의 정체입니다. 텅비고 조금 매운맛이죠?연습용으로 백지가 아닌 백지 버전도 한번 만들어봤어요아미노산의 골격
R군, 너 때문에 우리가 이런 고생을 하는 거야. 아미노산은 당연히 위와 같은 구조가 되지요.중심탄소(alphacarbon)에 아민기(NH3+)와 카르복실기(-COO-), 수소(-H)와 사슬(-R)이 부착되어 있습니다.
처음하는 공부라면, 가장 궁금한 것은 “왜 작용기마다 +토-“가 붙거나 떨어지거나 했다. 난리가 났나? 입니다.
이 불만을 극복하는 방법 중 길고 까다로운 버전은 유기화학 수강으로, 빠르고 쉬운 버전은 수소이온(H+)이 붙어 떨어지는 것은 산뜻하게 신경 쓰지 않도록 하는 것입니다.
그렇다고 적당히 수소가 묻어 있거나 떨어져 있거나 하면 곤란하므로 지금 위에 그려진 그대로 기억하시기 바랍니다.분자 속에 +1,-1이 사이좋게 떠있어 합치면 중성일 수 있습니다.
아미노산의 종류는 바닥 사슬, 즉 R 기에 어떤 구조가 붙어 있는지에 따라 결정됩니다.그렇기 때문에 이런 골격구조는 반복될 뿐이어서 이어지는 내용에서는 모두 생략하고 있습니다.
실제로 하나의 아미노산 구조를 그리려면 위에 나온 골격의 R 부분에 앞으로 보여줄 그림을 계속 그려야 한다는 것을 잊지 마세요!
Non – polar , aliphatic
제가 암기요령에서 자꾸 목이라고 부르는 건 아미노산의 골격과 연결되는 위치에 있는 – CH2- 입니다.중심탄소와 R기의 나머지 구성요소를 이어주는 연결부위 같은 놈이니까 모그로 부르기로 결심했습니다.
비극성 지방족 아미노산 친구들이 정말 최고로 한글 이름이 모두 자기 이름의 첫 글자이고, 세 글자 이름도 아이솔류신 빼고는 모두 자기 이름 앞에서 세 글자입니다. 근본적인 친구네요.
Glycine : 세계에서 가장 간단한 아미노산입니다. 아미노산 중 유일하게 카이럴성이 없죠 왜냐하면 아까 골격을 봤을 때 이미 중심탄소에 H가 하나 있었기 때문이에요
Alanine : 글리신에게 1위를 빼앗긴 콘라인 아미노산입니다. 그래도 탄소 정도면 꽤 간단하겠죠? 제 기준으로는 목만 매달려있고 그 아래는 없는 아이입니다.
Valine : 머리글자가 V여서 그런지 구조도 뒤집힌 V모양입니다.
Leucine : 머리글자는 L이지만, 조금만 | 를 빼면 숫자 4가 됩니다. C가 4개라는 신호네요.
Isoleucine : 류신의 가짜 버전입니다. 같은 C가 4개 있는데 하나가 목 부분으로 이사를 했습니다.
Methionine : 생명과학2를 경험하신 분은 지긋지긋한 시작 코돈의 바로 그놈입니다 그래서 시작(Start)의 의미를 담아서 외웠는데 달리기를 생각하면 “1, 2, 3, 이 땅!” 느낌 아시죠? 그래서 S가 세 번째로 온다는 기억!
아민기에게 듬뿍 안기다니 완전 여우 아니야? 아민기 빡빡이 프로구나 약간 교양 없는 암기법이에요 매우 특이한 고리 모양이기 때문에 아미노산 골격을 생략해서 표현할 수 없기 때문에 다 그린 거겠죠?
Aromatic
유기화학을 들으면 아로마 요법 같은 말이 안 들려요. 방향족이란 보시는 바와 같이 벤젠고리 등을 부르는 명칭입니다. 물론 이렇게 간단한 정의는 아니지만 저희 블로그 어딘가에 설명되어 있습니다.후각 신경은 쉽게 피로해지고, 같은 냄새는 오래 맡을 수 없다는 이야기를 들어 본 적이 있습니까? 전혀 관계없는 이야기지만 방향족 아미노산은 모두 한글 이름이 영문 이니셜이 아닙니다.
금방 피로해지는 후각 신경처럼 약해서 성이 같은 아미노산과의 경쟁에서 진 편이군요.
[Phenylalanine] 화학 배우신 분들에게는 껌이죠 Phenyl 알아차린 알라닌이라고 보시면 되요 알라닌이 목만 콜록콜록하던 거 기억나요? 대신에 한글이름이 P가 아니고 F입니다만, P에서는 이미 Proline이 가져갔다고 합니다. 영어 phenyl 발음이 F라서 붙여졌다고 합니다.
페닐알라닌에 알코올기(-OH)가 붙은 친구입니다. 두 번째 글자 T는 잠시 후에 소개하는 Threonine에게 뺏기고 Tyrosine의 두 번째 글자인 Y가 한 글자 이름입니다.
영어 이름, 세 글자 이름, 한 글자 이름, 구조까지 무엇 하나 빠지지 않고 모두 고생하는 놈입니다. 그래도 특별대우를 해서 외우면 결국 외우게 돼 있어요.방향족이니까 어쨌든 벤젠 고리는 있어야 되는데 처음에 목에서 연결되는 고리의 이중결합 부위가 어느 방향인지는 T의 첫 번째 선이 -인 점에 착안하십시오. 나중에 히스티진까지 보시면 뭔지 아실 거예요.
Polar , uncharged
술집에 가서 세트메뉴 시키면 싸죠. 주점은 알코올기(-OH), 세트 메뉴는 세린(Serine), 트레오닌(Threonine)을 연상시키기 위한 소리입니다. 모두 수산화기가 장착된 극성 아미노산입니다. 그러나 양전하 또는 음전하는 띠지 않습니다.
극성이긴 하지만, 전달하는 띠 없는 아미노산은 특히 세트가 많은 것입니다. 아스파라진과 글루타민도 세트네요.술(알코올기)에 진심입니다. 목 바로 밑에 술을 달고 계시네요. 주변에 세린이라는 친구는 없어요? 생화학 국가인 세린은 술을 지독하게 좋아해요.
Threonine : 세린의 목에 C가 하나 더 붙으면 트레오닌이 됩니다.
Cysteine : 생화학에서 나오는 이황화 결합(-S-S-)의 주인공, 시스테인입니다. 너무 솔직하게 목에 – SH가 붙어있는 게 끝이라 좋네요
Asparagine : 자신에게 아마이드가 있다는 사실이 너무 자랑스러운 것 같습니다. 세 글자 이름에서 영문 이름 앞에서 두 글자 + n인 위 N을 강조했는데, 결국 한글 이름은 그냥 N이에요.
Glutamine: 나중에 아스파라긴산과 글루탐산에서도 보실 텐데 아스파라거스와 글루터의 차이점은 목이 하나냐 두 개냐입니다. 목이 두 개면 깁스로 쳐서 깁스의 G인 걸 기억하세요.Positively / Negatively charged
다중분자인 아미노산의 세계에서 건방지게 전하를 띠고 있는 죄로 히스티딘을 제외하고 모두 한글 이름이 이상해졌습니다.Lysine : 오(5) 필승 라이징 (라이신) 코 (K) 리어 (아민)입니다.
Arginine : 아르(Arrrr….)라는 세 글자의 성어가 떠오르지 않으십니까? 그래서 목도 세 개, 일행과 떨어져 불쌍한 탄소 하나를 에워싼 깡패(N)도 세 개에요. 특히 전하 띠는 N은 두 손으로 C의 멱살을 잡았어요 알룰루에서 R이 강력해서 그런지 한글도 R이에요Histidine : 첫 번째 그림입니다. 트립토판과 달리 목으로 연결돼서 이중결합이 뜨는 방향이 안 좋아지네요 왜 중성으로 그려놓고 양전하를 띤다고 분류되는가 했더니 체내에서 주로 중성으로 존재하기 때문이래요 그러나 양전하를 띨 수 있기 때문에 여기에 속하게 된 것입니다.Aspartate:Aspartic acid는 카복실기의 H가 아직 떨어지지 않아 중성일 때를 말하며 음전하를 띠는 소금은 as partate입니다. 한 글자의 D는 aspartic acid의 마지막 글자인 D라고 합니다. 어이가 없군요.Glutamate: Glutamic acid에서 같은 D로 끝나는데 한국어 이름이 왜 E냐고 물어보면 알다시피 그루터 친구들은 아퍼의 아류이기 때문에 알파벳 순서대로 D 다음에 오는 게 E라는 것을 바탕으로 E가 됐다고 합니다. 한 번만 더 기가 막혀서 갑시다.여기까지 아미노산의 기억이 끝났습니다.혹시 틀린 점을 발견하셨거나 질문이 있으시면 언제든지 코멘트를 남겨주세요.~#아미노산구조 #아미노산 #아미노산표 #아미노산종류 #아미노산암기 #생화학 #생화학시험 #아미노산명칭 #아미노산암기법